El Magíster Salud Pública, Colectiva y Territorio tiene dos líneas de investigación:

Línea de Desarrollo I: Determinación del proceso de salud-enfermedad-atención en el territorio: esta línea de desarrollo analiza las características territoriales, epidemiológicas, económicas, políticas y sociales en las cuales las personas, familias y comunidades desarrollan su vida, y que determinan los procesos de salud, enfermedad, cuidado y muerte, como insumos y evidencias para la generación de estrategias colaborativas de intervención.

Línea de Desarrollo II: Gestión en salud comunitaria e institucional, políticas, planes y programas con perspectiva territorial: esta línea de desarrollo enfatiza en el análisis crítico de la gestión en salud ejecutada a través de políticas, planes y programas, con la finalidad de generar diagnósticos, mejoras, propuestas vinculantes y pertinentes considerando al territorio y sus actores como claves protagonistas en el proceso de la gestión en salud